Análisis de datos transcriptómicos

STAR + DESeq2 + g:Profiler2

bioinformatics
bulk-RNA-seq
2024
Clases para los alumnos de Ciencias Genomicas de la UNAM dentro del programa Bioinformatica y estadistica 2
Author

Evelia Coss

Published

February 27, 2024

Información general

  • Fechas: 27 al 29 de febrero, 1 marzo, 2024
  • GitHub: RNAseq_classFEB2024
  • Especie: Mus musculus
  • Bioproject: PRJNA649971
  • Pipeline: Alineamiento y conteo con STAR + DESeq2 + g:Profiler2

Plan de estudios

  • Dia 1. Aspectos generales de RNA-Seq / Control de calidad de los datos | 27 febrero | Presentación
  • Dia 2. Diversos pipeline para Alineamiento, ensamblaje y conteo de reads | 28 febrero | Presentación
  • Dia 3. mportar datos en R, Normalización y Corrección por batch / DEG con DESeq2 | 29 febrero | Presentación
  • Dia 4. GSEA - Análisis funcional | 1 marzo | Presentación
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