Análisis de datos transcriptómicos

STAR + DESeq2 + g:Profiler2

bioinformatics
bulk-RNA-seq
2025
Clases para los alumnos de Ciencias Genomicas de la UNAM dentro del programa Bioinformatica y estadistica 2
Author

Evelia Coss

Published

February 25, 2025

Información general

  • Fechas: 25 y 27 febrero, 4 y 6 marzo, 2025
  • GitHub: RNAseq_classFEB2025
  • Especie: Homo sapiens
  • Pipeline: Alineamiento y conteo con STAR + DESeq2 + g:Profiler2

Plan de estudios

  • Dia 1. Aspectos generales de RNA-Seq | 25 febrero | Presentación
  • Dia 2. Diversos pipeline para Alineamiento, ensamblaje y conteo | 27 febrero | Presentación
  • Dia 3. Importar datos en R, Normalización y Corrección por batch / DEG con DESeq2 | 4 marzo | Presentación
  • Dia 4. GSEA - Análisis funcional | 6 marzo | Presentación
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